同济大学等学者取得DNA测序技术的重要突破( 二 )
Ucaps-seq测序技术是国际上第一个酶法检测DNA中的dU碱基的技术 , 现存的dU测序技术均为化学法 。酶法测序技术优于化学法测序技术 。酶法测序技术的优点是:灵敏性好、特异性强和分辨率高 。其他优点包括:效率高成本低 , 很少发生假阳性 , 也很少受到干扰因素的影响 。例如 , 既有的DNA的dU化学测序技术需要先利用UNG酶切除dU成为无嘧啶的位点 , 而这样的处理较难与DNA自身存在的无嘧啶位点区分 , 不可避免地导致假阳性的发生 , 而Ucaps-seq测序技术则很少出现假阳性 。再例如 , Ucaps-seq测序技术可以排除其它碱基衍生物如5-羟甲基尿嘧啶的干扰 。
研究人员利用该技术还做了进一步的验证和探索工作 。他们首先在合成的DNA探针模型上验证了Ucaps-seq测序技术的原理 , 然后在诱变后的癌症细胞和B细胞中验证了Ucaps-seq测序技术的单碱基分辨率效能 , 最后还应用该技术对基因编辑脱靶进行了评估 , 发现Ucaps-seq测序技术对基因编辑脱靶具有强大的识别能力 。
论文的通讯作者为中国科学院院士陈义汉教授(同济大学附属东方医院、同济大学医学院和同济大学心律失常教育部重点实验室)、马红辉研究员(同济大学附属东方医院和同济大学心律失常教育部重点实验室)和胡晋川研究员(复旦大学生物医学研究院和上海市第五人民医院) 。论文的第一作者为江柳丹(同济大学博士研究生 , 导师为陈义汉院士和马红辉研究员)、尹家勇(复旦大学硕士研究生)和钱茂祥研究员(复旦大学生物医学研究院和复旦大学附属儿科医院) 。
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文:新闻中心
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